Pôle Imagerie
Personnel affecté : Jerome Mutterer (responsable), Patrice de Ruffray
Mission
Le pôle imagerie a pour mission de faciliter pour les utilisateurs de la plateforme la gestion et l'exploitation des données biologiques particulières que sont les images. Ces objectifs sont réalisés par la mise en place d'un système de base de données d'images (OMERO, The Open Microscopy Environment), le développement de modules spécifiques de traitement et d'analyse d'image, le plus souvent basés sur ImageJ, ou d'applications spécifiques (voir Anthos).
Modules pour ImageJ
LSM Reader. Relecture des images de microscopie confocale
Action Bar. Création d'interfaces pour ImageJ
Droplet. Traitement d'images par glisser-déposer
IJ_Ed. Utiliser jEdit depuis ImageJ
Macro Serial Extensions. Jeu d'instructions supplémentaires pour l'accès au port série depuis le langage macro.
FigureJ. Création de figures d'article avec lien vers les données originales et historique de traitement.